WebTop100 hodnotí prezentace v celkem 30-ti kritériích. V letošním ročníku WebTop100 byla změněna metodika i způsob hodnocení přihlášených firemních prezentací. Každý web přihlášený do oborových žebříčků prošel hodnocením pěti odborných porotců, kteří se zaměřili na hodnocení designu a grafiky, technického řešení, použitelnosti, marketingové hodnoty a obsahu prezentací. Odborná hodnocení proběhla na základě předem vytvořené komplexní metodiky. Obsahu firemních prezentací byla v letošním roce věnována značná pozornost, a proto organizátoři soutěže oslovili pro každou kategorii specialistu v daném oboru, který provedl oborové zhodnocení.
Každý z přihlášených účastníků oborových žebříčků WebTop100 obdrží od odborných i obsahových porotců slovní hodnocení prezentace s doporučeními pro její úpravy a další rozvoj.
Soutěž Webtop100 již pět let organizuje profesionální poradenské centrum v oblasti tvorby www stránek Dobrý web, podnikatelská síť sdružující profesionály z oblasti technologického podnikání TUESDAY Business Network a ekonomický měsíčník BIZ.